Pesantren al-Akiya’ juga memiliki kegiatan harian selayaknya pesantren mahasiswa pada umumnya, yang diadakan setiap ba’da subuh, maghrib dan isya’. Untuk kegiatan setelah subuh dan maghrib diisi dengan mengkaji kitab kuning, kecuali untuk hari Jumat dan Sabtu. Pada hari Jumat setelah Subuh kegiatannya adalah Khotmil Quran dan untuk kegiatan hari Sabtu sehabis maghrib adalah pembelajaran Kaligrafi. Dan untuk kegiatan selepas isya’ adalah membaca Al-Quran yang dilakukan setiap hari, kecuali untuk hari Kamis. Khusus untuk hari tersebut, acara setelah maghrib adalah pembacaan Yasin dan Tahlil, dan sesudah isya’ diadakan Pembacaan Maulid Diba’, Mujahadah dan Burdah.
Adapun kitab – kitab yang dikaji di PP Al-Azkiya’ adalah:
Adapun ekstrakurikuler yang disediakan Pesantren al-Azkiya: